在这项研究中,我们展示了我们的工作参与BioCreative VII挑战的药物支持。药物靶靶相互作用(DTI)对于药物发现和重新施加至关重要,其通常从实验制品中手动提取。有关PubMed的32M生物医学文章和手动提取来自这种巨大的知识库的DTI是具有挑战性的。为了解决这个问题,我们为赛道1提供了一种解决方案,旨在提取药物和蛋白质实体之间的10种类型的相互作用。我们应用了一个组合生物向罗伯塔,艺术语言模型的艺术状态的集合类模型,卷积神经网络(CNN)来提取这些关系。尽管Biocreative VII药物测试语料库中的阶级失衡,但我们的模型与挑战中其他提交的平均值相比实现了良好的性能,微F1分数为55.67%(生物重建VI Chemprot测试语料库)。结果表明,深入学习在提取各种类型的DTIS方面的潜力。
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